吃生鸡蛋或不熟的鸡蛋不仅消化率比煮鸡蛋低30％—50％，而且对身体有很多不利。一方面，生鸡蛋的蛋清部分含有一种对人体有害的碱性蛋白质———抗生素蛋白，这种抗生素蛋白在肠道能与生物素紧密结合成为一种复合物，这种复合物非常稳定，人体无法吸收。当大量的生鸡蛋清进入人体，产生了较多的复合物，阻碍了人体对生物素的吸收时，人体便可能患生物素缺乏症。鸡蛋经加热处理后，这种抗生素蛋白即被破坏，不再具有妨碍生物素吸收的作用。另一方面，在显微镜下观察，鸡蛋外壳充满小孔，这些小孔比致病菌要大几十倍至几百倍。因此，鸡蛋里随时都可能有病原体侵入。食用被病原体感染的鸡蛋，人体可能出现畏寒、发热、恶心、呕吐、腹痛、腹泻等食物中毒现象。
民间认为，鸡胚蛋具有补气之功效，常食用可使面色红润，食欲增加，身体强壮，并延缓衰老等。按说鸡胚蛋蛋白质含量较高，这是因为鸡蛋在孵化期间，营养不但没有受到破坏，反而经孵化有所增强。另外，它含有类似“人体胎盘”的某些成分，能改善胃肠功能，有增进食欲和抗衰老作用。但是，在市场上出售的鸡胚蛋大多是用于孵化小鸡的鸡蛋，是因温度、湿度不当或感染病菌而发育停止死于蛋壳内的鸡胚蛋。这种死胚蛋中原来含有的蛋白质、脂肪、糖类、无机盐及维生素等营养成分已全部或部分发生变化，绝大部分已被胚胎利用和消耗，所剩营养成分甚微。经测定，死胚蛋里几乎100％含有病菌，如大肠杆菌、葡萄球菌、伤寒杆菌、变形杆菌等。食用这种不新鲜的死胚蛋不但营养价值不高，且容易发生中毒，引发痢疾、伤寒、肝炎等疾病。
此外，豆浆冲着鸡蛋喝、宁吃小个的土鸡蛋也不吃大个的大种鸡鸡蛋等，也是不正确的吃鸡蛋习惯。
