法则1：学习你所在机构或实验室的笔记本方案

实验室笔记本对于良好的记录保存、研究管理、保护知识产权和防止欺诈来说是非常重要的工具。对于先进的研究机构、公司的研发部或者大学的研究实验室来说，完整规则的实验室笔记本策略应该要被落实。在缺乏一个制度政策的情况下，你的研究小组应该有一个统一的方案来规划所有研究成员日常记录的进程，例如：实验室的使用及维护情况。如果您的机构或实验室没有一个标准的方案，那么以下的一些法则是给你为保持记录科研活动提供一些指导，可能这些记录对你、你的主管或者你的同行都非常重要。

法则2：为你的实验室笔记选择合适的媒介

这里有三种实验室笔记本类型：装订或缝合的笔记本，单页或活页笔记本以及基于计算机的电子笔记本。每种笔记本都有各自的优点和缺点。而你需要为你的研究去选择合适的笔记本类型。大多数的计算生物学家会在同一时间处理多个项目。如果你觉得只利用一个实验室笔记本来记录实在是太复杂，那么你可以用多个笔记本分别记录不同的项目。另外，你也可以使用活页笔记本（将不同的项目名称写在标签上然后贴在笔记本上，每个项目的内容则在标签后一页开始记录，以此分别记录各项目）。您还可以选择使用电子笔记本，它的优点是容易搜索并且计算机生成的数字可以被迅速复制到笔记本中。如果你不能识别合适的编辑方法，那么制作一个完美的电子笔记本是非常费时的。有些实验室使用Microsoft Word来编写实验室笔记本并保存为“网页”形式，然后将条目自动保存至WordPress.com。微软的OneNote是一个专有的软件选项。如果你写了大量的计算机代码以及收集了大量的数据，那么电子笔记本对你来说是更好的选择，因为你可以存储并链接你的代码和数据到你的电子实验室记录中。电子实验室笔记本可以在不同的电脑中共享，也可以将其与同事在线交流。但是如果你还没有合适的技术用于电子实验室笔记本的保存，那么你可以先将计算机代码和数据保存在一个安全的介质中（如硬盘，CD-ROM，云存储，数据库，纸质副本等），另外再将易于识别的代码或数据记录在你的纸质笔记本中。

法则3：养成在桌上放一本实验室笔记本的习惯

你需要随时拿着你的实验室笔记本，并且在工作中及时书写记录。如果你依靠回忆来记住会议上的好主意、建议或利用回忆数据来分析及模拟模型中的重要步骤，那么你会发现自己在某些情况下是不会拥有批判性思维的。此外，通过做笔记你将发现写作可以为这些想法提供思考的机会，以此通过逻辑来论证猜想、结果或结论即笔记有助于实现科研中的批判性思维。

法则4：在你的实验室笔记本中记下所有的科研活动

有很多科学家相信实验室笔记本中对应的干性或湿性实验操作条目的记录应该是有限的。然而，一个理论科学家的智力活动不应该被实验来限制假设。当你思考可能的研究方向和理论是如何作用于系统的时候往往能产生一些突破性的科学想法。如果你使用纸垫或其他纸来写下你的想法或会议和研讨会的笔记，之后你可能会遗失这些重要的想法或浪费太多的时间去寻找这些想法。所以，在笔记本中记录你所有的科学活动将解决这个问题。科学家应该记录每一次实验、每一个研究结果、每一次研究会议，并保留研讨会的笔记、研究会议的电话以及与他们研究所相关的问题，所有的这些项目都要写入实验室笔记本中。在一个非常真实的方式中，实验室笔记本是每一项学术活动按时间顺序记录的日志。当科研活动或者工作结束后，你应该立刻在实验室笔记本上写下所有的条目。

法则5：每一各项目都应该连同日期、主题和方式一起被记录

实验室笔记本最合乎逻辑的组织是按时间顺序排列的。每一个项目都应该包含它的日期和主题。如果你在同一天内进行了不同的工作项目，那么在笔记本上你应该使用标题区分，并在各项目之间留下足够的空间。工作项目的标题是非常重要的，他们应该是简短的、尖锐的并且富含信息的，因为你会利用它们来建立实验室笔记本的目录。如果你使用的是纸质的笔记本，你需要写上日期和工作时间点以此使项目记录更为清晰；另外，你也可以使用永久性墨水及实验室每个人都能理解的通俗语言来记录。如果你使用的是电子类笔记本，那么每个项目的日期和时间点将自动保存在每个主题下。

法则6：记录每一个结果产生的过程

科学的黄金标准是可重复性。你需要记录你的每一个实验结果是怎样产生的，是通过计算机实验、数理统计还是数学模型。应注意实验操作步骤的顺序对于实验结果和分析是不是可以复制重现。在你的模型、分析或实验中，每一个步骤你都应该记录其细节及影响。这包括干性或湿性实验、预处理过程、中间步骤、分析与后处理结果。你应该存储所有的原始数据。这将为实验结果的可视化提供确切的数值。

法则9：为你的实验室笔记本创建目录

当你完成一个项目或者完成一天的工作时，你应该将已完成的项目标题在实验室笔记本的目录中标出。类似这样的索引标志是为了帮助你、你的导师或者其他人迅速有效的查看你的工作。目录的形式是多种多样的。你应该使用在所在实验室规定的格式。一般来说，每一个记录在目录表中的项目都应标明起始日期、主题以及笔记本中对应的页码。为了在实验室笔记本中快速找到所需信息，你应该将每一个项目的开篇记录在新的页面上。然后，编辑标签和日期。当你做到这一点，你便可以开始做笔记并尽可能多的记录你需要的内容。如果你采用标准的纸质笔记本，其页面是已经有编号的。现在你将进行最为关键的一步：在你笔记本的第一页上创建一个目录并编辑你将记录的科研事件及页码。如果你没有标准的实验室笔记本，你自己可以在每一页顶端编辑页码。另外，使用电子实验室笔记本的一个优点是你无需担心如何创建一个目录，因为电子笔记本会在你完成输入时自动保存。

法则7：保护你的实验室笔记本

纸质的实验室笔记本是不应该被任何人带回家的。当你每天离开实验室的时候，你应该将你的笔记本放在能够找到的地方。最好是你每天都把它锁在同一个地方。如果你的研究机构或实验室主管允许，那么你将有权复印你的实验室笔记本，但是笔记本的原始版本还是属于支付你工资和处理你研究项目的机构的。