LC-MS液质联用仪是绝大多数化学公司，科研单位都会用的仪器。它大大的提升了实验员的效率，帮助实验员快速判断化合物合成状态和分子量。LC-MS是HPLC和MS的结合，有两者的功能，又没有两者精确。

液质联用(LCMS):LC为液相色谱仪；MS为一种能够生成离子，在气态中根据质荷比的不同将其分离并进行检测的仪器。

LCMS以液相色谱作为分离系统，质谱作为检测系统，因而兼具有液相色谱高分离度与质谱高灵敏度的特点。

分析的样品在质谱部分和流动相分离，被离子化后，经质谱的质量分析器将离子碎片按质量数分开，经检测器得到质谱图。 

原理：质谱分析是先将物质离子化，按离子的质荷比分离，然后测量各种离子谱峰的强度而实现分析目的的一种分析方法.以检测器检测到的离子信号强度为纵坐标，离子质荷比为横坐标所作的条状图就是我们常见的质谱图 。

相关概念

离子丰度（Abundance of ions）：检测器检测到离子信号强度。

相对离子丰度（Relative abundance of ions）：以质谱图中指定质荷比范围内最强峰（基峰）的强度为100%。其它离子峰对其归一化所得到的强度。标准质谱图均以离子相对丰度值为纵坐标。离子的丰度与物质的含量相关，因此是质谱定量的基础。

EI：电子轰击源质谱，常用于GC-MS系统。

API：大气压电离源质谱，常用于LC-MS系统。

MALDI：基质辅助激光解吸电离源质谱，常用于生物大分子分析。

HPLC：高效液相色谱法（High Performance Liquid Chromatography \ HPLC）又称“高压液相色谱”、“高速液相色谱”、“高分离度液相色谱”、“近代柱色谱”等。高效液相色谱是色谱法的一个重要分支，以液体为流动相，采用高压输液系统，将具有不同极性的单一溶剂或不同比例的混合溶剂、缓冲液等流动相泵入装有固定相的色谱柱，在柱内各成分被分离后，进入检测器进行检测，从而实现对试样的分析。

UPLC：超高效液相色谱（Ultra Performance Liquid Chromatography，UPLC）色谱理论认为提高色谱柱的效能（efficiency）就能增加仪器的解析度（resolution），而运用粒径低于2μm的小颗粒无疑是增加效能的好方法。但减小固定相的粒度以增加色谱柱效能一直是色谱仪器科学的瓶颈，因为小颗粒不仅要求系统能承受高于目前极限压力（比如6000psi/400bar），需要更小的系统体积（死体积），并且需要能适应可能只有几秒峰宽的高速检测器。

ESI：Electron Spray Ionization的缩写，意思是电喷雾离子源，是质谱仪中较为常用的一种离子化方式。电喷雾离子源属于一种软电离源,能使大质量的有机分子生成带多电荷的离子。

APCI：Atmospheric Pressure Chemical Ionization的缩写，大气压化学电离源 APCI是20世纪90年代后使用的液相色谱和质谱联用的接口技术之一。溶液在气流作用下形成气溶胶，蒸发，电晕放电使溶剂电离，电子转移或电子捕获，使样品带电。

看LCMS步骤

1）先看MS部分，看有没有所要离子峰，并且要看清楚该化合物是否有MS信号，是否掩盖周围的峰。

2）再看HPLC部分，看含量有多少，并且要看清楚该化合物是否有强的HPLC信号，是否掩盖周围的峰。

3）两者结合起来看，推测反应进行的程度和反应产生的杂质。

常见加合离子峰

[M+1]：加质子

[M+14]：羧酸与甲醇成酯

[M+18]：加NH4

[M+19]：加水（水合）

[M+23]：加钠离子

[M+39]：加钾离子

[M+42]：加乙腈

[M+64]：加乙腈加钠离子（常见于SHIMADZU）

[2M+1]：二聚离子（两分子公用一个正电子）

[2M+23]：二聚加钠（两分子公用一个正电子）

[M+2/2]：分子中有两个叔氮，容易上两个质子

[一系列相差42的峰]：可能为石蜡油污染

[一系列相差44的峰]：可能为聚乙二醇污染

[M-16]：脱NH3

[M-17]：脱水

[M-44]：羧酸和Cbz中常见，重排后脱CO2

[M-56]：Boc中常见，脱叔丁基

[M-100]：脱Boc

[M-H]：基本离子

[M+X]：X指溶剂或缓冲液中的阳离子

[M-H+S]：溶剂加合离子

[M+2）/2]：分子络合两个氢离子，半峰

负模式

[M-1]:M-H-

[M+X[:M+X-, X=溶剂或缓冲溶液的阴离子