长期保持引物和探针的稳定性关键有四点：

（1）低压冻干的引物在储存时间和温度方面具有更好的灵活性。引物一旦重新溶解，即应置于 -20°C 保存，且若保存时间超过一年则应对其进行监测，看它是否出现功能下降。

（2）对于标记的引物和探针，则应采取措施避免标记物暴光 (例如使用不透明管及置于暗处保存)，以延长它们的使用寿命。

（3）引物浓度也可影响其稳定性。建议引物的储存浓度不低于10 μM；实际上，在大多数情况下，100 μM 的引物浓度操作更简单。引物和探针还应分装保存，以减少冻融次数，特别是标记的引物和探针。

（4）最后，TE 缓冲液可形成比水更为稳定的环境。此外，含有 0.1 mM EDTA的 TE 缓冲液 (标准 TE 中含有 1 mM EDTA) 是一种理想的溶液，这是由于一些 PCR 反应对 EDTA 的灵敏度可能有一些残存。