目前市场上销售的纯净水主要通过蒸馏和逆渗透技术加以净化。这些技术原来是应用在工业上的，在去除水中有害杂质的同时，也将一些对人体有益的元素一起摒除，如镁、锌、铁等矿物质和无机盐。人体所需的十多种微量元素，主要来源之一就是饮用水。长期饮用纯净水，即使调整食物结构，有些微量元素也很难从食物中获得。
实验证明，让老鼠长期饮用蒸馏水，会导致生长缓慢，体重下降，肌肉萎缩，肾上腺素系统功能受到破坏。如果长期饮用纯水，人体会因缺少某些必要的元素而造成营养失衡。
医学专家还认为，桶装密封的纯净水，一旦启封与空气接触，如不在短期内用完，24小时后就开始滋生细菌。如保管不当，还会引起二次污染。纯净水一旦受到污染，细菌会很快繁殖，因为纯净水对细菌毫无抵御能力。据卫生防疫部门检验，在夏季48小时以内、冬季l周内饮用较安全，超过这个期限，纯净水即开始滋生细菌，并逐步使水变质。因此，一些饮用纯净水的家庭把一桶纯净水喝上几周的做法是不安全的；有的一次买几桶备用，更是不科学的。使用净水器的，如不能按规定时间更换活性炭和超滤膜等，同样会造成二次污染。
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