利用沼气贮藏苹果，投资少、操作简便、效益显著。用沼气贮藏的苹果与用普通袋贮藏的苹果相比，硬度高0.32～0.33kg／cm2，可溶性固形物含量高0.72％左右，水分消耗少0.3％～1.8％，优果率高13.6％～15.1％，且口感好，贮藏时间可达200天以上。具体操作方法如下：
    确定合适的贮藏形式通常有容器式、薄膜罩式、土窖式、贮藏室式４种贮藏形式。容器式和薄膜罩式具有投资少、设备简单、操作方便等优点，但贮藏量小，适合短期贮藏；土窖式和贮藏室式投资较大，密封技术要求高，但贮藏容量大，使用周期长，环境条件受外界干扰小，适合长期贮藏。用沼气贮藏苹果，一般选择贮藏室式。
    果实处理10月中旬采果后将苹果预冷３天左右，散去苹果的田间热。将无病虫害、无损伤的好果装入塑料筐、纸箱或聚乙烯塑料袋中，放入用聚乙烯薄膜密封的贮藏室内，外设水银温度计和相对温度计，以便随时检查室内的温度和湿度变化情况。果品箱堆好后封门，并用胶带纸或其他密封材料密封门缝。
    向贮藏室定量充入沼气充入沼气的初始含量为5％～7％，10天后将沼气含量调整为12％～16％，使贮藏室环境气体的含氧量保持在３％～10％，二氧化碳含量保持在２％～10％。
    温度、湿度控制一般情况下，贮藏室的温度应保持在1℃～5℃，湿度应保持在80％～90％。
    日常管理贮藏室充入沼气后的前两个月，每隔10天将苹果翻动一次。翻动时，应及时检查贮藏状态，如有烂果、伤果应马上挑出。以后每月翻动一次，并进行换气。换气时间一般在低温季节的上午10时至下午4时，温度较高时换气宜在夜间进行。同时，可定期用２％的石灰水对贮藏室的地面、墙壁、果箱等进行消毒，保持环境卫生清洁。