甲硝唑为抗阿米巴和滴虫的药物，对各种厌氧菌感染也有良好的治疗效果，且不易形成耐药菌株、菌群失调和二重感染，与常用抗生素合用无拮抗作用。经临床实践证明，该药对治疗鸡生殖系统疾病及一些传染病引起的生殖系统炎症效果好。

治疗蛋鸡腹膜炎 应用阿莫西林加甲硝唑联合治疗，即在鸡饮水时，按每100公斤纯水加入10克阿莫西林，同时在每公斤饲料中加入甲硝哇0.8克，连续使用4~5天。用药后第四天产蛋率回升，不再出现卧地不起、拉蛋黄样粪便的鸡，用至第五天产蛋率达到80%，再巩固用药3天，鸡完全恢复产蛋。

治疗蛋鸡弧菌性肝炎 在每公斤饲料中拌入甲硝唑0.8克，连续饲喂7天，停2~3天，再喂7天，治疗效果良好。

治疗蛋鸡滴虫病 在每公斤饲料中拌入甲硝唑0.88克，连续饲喂5~6天，10天后鸡可痊愈。