在低温情况下（8℃~20℃），草鱼的新陈代谢能力较弱，通过接种途径可使二龄草鱼获得新的免疫抗原剂量，经过5~30天的低温（10℃~15℃）诱导，接种过疫苗的草鱼鱼种完成初次免疫，待水温在20℃以上时草鱼的免疫抗病水平得到迅速加强，从而达到减少二龄草鱼发病机会的目的。

时间选择 接种疫苗宜选择在水温8℃~22℃的春季进行，以利于水霉病的预防。患病的草鱼不宜接种疫苗。

鱼种准备 规格在8.3厘米以上的各种健壮无病的草鱼鱼种均可实行免疫接种，接种前用0.5%的食盐水对鱼种进行消毒处理，时间控制在5~10分钟。为了便于生产操作，可用敌百虫水溶液对鱼种进行麻醉处理。

工具选择 接种器、针头以及稀释器皿须用75%的酒精消毒或用开水煮沸消毒。规格在10厘米以下的鱼种一般选用4.5号或5号接种针头，规格在10~16.7厘米的鱼种一般选用5.5号或6号接种针头，规格在16.7厘米以上的鱼种一般选用7号接种针头。为了防止接种时入针太深伤及鱼体内脏，可在接种针头上套一小截塑料管，使暴露出的针尖长度略长于鱼体腹肌厚度。

疫苗稀释 在使用前需先用0.65%的生理盐水将浓缩液稀释10倍，一瓶稀释好的疫苗尽可能一次用完，如一次用不完，可用接种器抽取需要量使用，抽取后用医用胶布封住瓶口针眼。

接种部位及剂量 在草鱼的腹鳍基部接种，将针头与鱼体以45度角刺入鱼体。规格在10厘米以下的鱼种每尾接种0.5毫升稀释后的疫苗，规格在10~16.7厘米的鱼种每尾接种0.5~1毫升稀释后的疫苗，规格在16.7厘米以上的鱼种每尾接种1毫升稀释后的疫苗。