在鱼苗孵化过程中，提前脱膜和出现畸形胚胎等现象时有发生，严重影响出苗率。

凡孵化池内壁粗糙的须用砂轮打磨光滑，放卵时掌握合适的密度，一般每立方米水体放卵80万粒左右；孵化用水要清洁无污染，并有较大流量；偏酸性的水，可在蓄水池中泼洒生石灰浆调节，使pH值保持在7~8之间；若发现孵化池中已有少量鱼卵提前脱膜时，可适当关闭小进水阀门，并将高锰酸钾溶液泼入孵化池中，使池水呈5ppm~10ppm浓度，保持5分钟~8分钟，处理后的鱼卵卵膜会变得较为牢固，不易破损，有防止提前脱膜的作用。

过熟的鱼卵，以及营养不良的亲鱼产出的鱼卵，最易形成畸形胚胎。温度的变化，尤其是在鱼卵受精阶段、卵裂初期和脱膜前后，水温剧变均会导致畸形胚胎增加。不良的孵化水质也会影响胚胎的正常发育，产生畸形胚胎。因此，一年一度的鱼苗繁殖工作，既要抓好亲鱼的培育，又要选择合适的时机及合适的天气进行亲鱼催产。

剑水蚤是鱼苗孵化阶段最大的敌害，当其大量侵入孵化池，就会咬破鱼卵或咬死子鱼，故而产卵池与孵化池用水要严加过滤。若发现孵化池中剑水蚤较多时，可适当关闭小进水阀门，进水量以鱼卵能翻滚不下沉为准，将装有90%的晶体敌百虫的塑料瓶钻数个小孔，挂在蓄水池通往孵化池的供水口处杀灭剑水蚤。