芦苇的发生与耕作制度有密切关系，连续旱作，对其生存繁殖不利，芦苇密度较低；水旱轮作，为芦苇的发生和繁殖提供了条件，芦苇在稻田完成全生活史，而主要在麦田危害。另外，近年来推广免少耕种植技术，对芦苇根系伤害轻，有利于芦苇繁殖。

芦苇为多年生恶性杂草，有粗壮的地下茎，同时芦苇和小麦、水稻同属禾本科，因而在芦苇和小麦、水稻混生的田块很难使用选择性除草剂消灭芦苇。

在小麦蜡熟中期（茎秆及剑叶呈黄绿色，中下部叶片全黄，麦粒玉色）喷施草甘膦，用药后4～5天芦苇心叶枯黄，心叶基部腐烂，茎秆基部呈浅褐色，潜伏芽呈水渍状。每亩喷施农达400毫升，药后6天芦苇株高在50厘米以下的植株全株枯死，80厘米以上的植株只是心叶枯死。施药后10～20天，芦苇叶片呈深绿色，仍不枯死，如果不辅之以耕翻晒垡摧毁其地下根茎，芦苇茎秆仍然不倒，而叶片渐呈枯白色，茎基部长出较多的细长丛枝。草甘膦能通过芦苇的茎叶传导到地下根茎，加上后茬作物播种前需要耕翻整地，可以促进芦苇根系死亡，减少下一年麦田芦苇的发生量。由于小麦从蜡熟中期到蜡熟末期一般需4～5天，此阶段的灌浆速度已经很慢，而在蜡熟中期施用草甘膦，从施药到芦苇心叶枯黄和小麦枯死要4～5天时间，与小麦从蜡熟中期自然过渡到末期所需的时间基本吻合，所以蜡熟中期施药对小麦灌浆无明显不良影响。

另外，有资料报道，在芦苇生长期，有选择地对田间少量的芦苇用适当浓度的草甘膦、盖草能、精禾草克等内吸性除草剂涂抹芦苇叶片，能有效地将芦苇连根杀死，防止其在田间蔓延。用药时注意不要让稻、麦植株接触到药物，否则会产生药害。