冻害出现时小麦正处于拔节期，大部分小麦已拔出2节。一般情况下，小麦第一节间很少受病菌侵染，主要在第二、第三节间显症，表现为节间失水、发黑、腐烂，上部叶片发黄。受基腐病危害的小麦，严重的整株枯死，不枯死的植株上部叶片发黄，后期不能抽穗。史建荣研究员说，最近他在各地田间调查时还看到，有的植株节间并没有全部枯死，只是半边枯死、腐烂，从根部吸收的养分能少量向上输送，成形的穗子还能抽出；有的植株病节上部已经枯死，从基部节上有新的小分蘖发生。这些小分蘖只要条件适合，同样可以利用成穗。以前也有过这样的技术，即在主茎第二节间受冻导致植株第二节间上部死亡后，可以利用基部节上发生的蘖芽生长成穗。想要这些小分蘖成穗，就要求分蘖发生的时间必须在3月底之前，并且主茎已经死亡。如果小分蘖在3月底前产生，但是主茎未死亡，大部分养分会供应主茎，小分蘖得不到充足的养分，成穗的希望不大。如果小分蘖现在才开始发生，或者分蘖较小，没有剥查到穗子，就没有成穗的希望。

对小麦基腐病没有太好的药剂可以防治，目前是防治小麦蚜虫、白粉病和赤霉病的关键时期，应及时用药防治，兼防基腐病。对发生新分蘖的植株，应适当补施一些速效性氮肥促进分蘖生长成穗，每亩施尿素10公斤。一般小分蘖穗成熟期会比正常出生的大分蘖穗迟10天左右，但对同时收获没有太大影响，只是产量会低一些。