农业防治选择地势高燥,排灌方便的地块种瓜。土地应深翻,促使50厘米深的土壤疏松通透,促进根系生长发育,提高抗病力;避免连作,与非瓜类作物进行轮作换茬,降低发病率;施用腐熟好的有机肥,适当增施磷、钾肥,控制氮肥用量;清洁田园,将病株残体集中于田外烧毁;采用无病的大田土育苗,防止幼苗感染;发病严重的地块,可用抗病的葫芦做砧木嫁接育苗。
物理防治将干西瓜种子,在70℃恒温箱中处理72小时;用55℃温水浸种20~30分钟。
药剂防治选用40%的甲醛150倍液浸种1~2小时后洗净晾干播种,或50%的多菌灵可湿性粉剂用50℃~60℃温水配制成1000倍液浸种30~40分钟,洗净后催芽播种。药剂处理土壤,用50%的多菌灵可湿性粉剂每亩3~5公斤,拌土200公斤,均匀盖种或施于定植穴内;发病初期用50%的多菌灵可湿性粉剂500倍液,或2%的农抗120水剂200倍液灌根,每株0.25~0.5公斤,防治1~3次。