农业防治。选用无病的种蒜、无伤、大小均匀的新鲜种蒜，与非葱蒜类作物实行3~4年轮作，有机肥必须经过高温发酵腐熟后施用，并且在用作基肥时，深埋入土与种蒜隔离，蒜蛆喜湿怕干，在大蒜根部周围，每亩撒施草木灰150~200公斤，防治效果较好。蒜蛆发生地块，必要时用大水漫灌1次，可减轻发生。

物理防治。在根蛆成虫发生期可用红糖水、醋、水按1：1：2.5的比例配成诱杀液，并加入锯末和敌百虫拌匀，放入诱杀盆中，在蒜地连片诱杀成虫，这样在产卵前杀灭成虫，可收到事半功倍的效果。结合浇水，追施对蒜蛆有一定驱杀作用的氮硫肥，以减轻受害程度，在大蒜烂母期前灌施两次氨水，有驱避成虫的作用。烂母期少灌水，以减少卵量。

药剂防治。结合播种每亩用5%辛硫磷颗粒剂3~4公斤拌饼肥或细土50公斤，撒施于播种沟内。选出健康无病的种蒜进行药剂拌种处理，即每50公斤用80%敌百虫20倍液5公斤拌种，或用50%辛硫磷乳油100~150毫升加水25~30公斤，拌种蒜200~250公斤，随拌随播。幼虫发生初期，将2.5%敌百虫粉剂撒在植株基部及其周围土壤中。也可以选用90%敌百虫800~1000倍液、50%辛硫磷乳油2000倍液、40%乐果乳油1000倍液、除虫菊酯400倍液、硫酸亚铁300~400倍液、48%乐斯本乳油1000倍液灌根防治。将喷雾器喷头上的旋水片取出，把药液注入根部土壤中，10天一次，视虫情防治2~3次。在成虫盛发期，及时喷药防治。每亩用2.5%敌百虫粉剂1.5~2公斤，或者选用40%乐果乳油1000倍液、2.5%溴氢菊酯乳油2000~3000倍液、25%辛吡乳油2000~2500倍液灌根，每隔7天一次，连续防治2~3次，以上午9~11时施药效果最好。也可以用80%敌敌畏600~800倍液拌适量麦糠均匀撒施，熏杀成虫，7~8天后再撒一次。