种肥施用的关键是除了掌握适当数量，还要注意施肥位置，少量的肥料应施在种子斜下方3~5厘米处，切忌将化肥紧靠种子，否则即使数量合适，也可能出现烧苗问题。在机械播种的条件下，要将种子和肥料分别从两个储备箱和两条下种管播下，使肥和种不处在同一平面上，以保证安全出苗。

并不是所有的氮肥品种都适合作种肥，既要严格控制种肥施氮量，又要选择氮肥品种。单质氮肥、硫铵适合作种肥，而碳铵、氯化铵、硝铵和尿素均不适宜。近年来，在各地因种肥施用不当而引起烧苗烂种的教训值得汲取。例如，用高塔高氮复合肥作种肥，凡用量较大(超过10公斤／亩)和肥料入土不深的，都出现了不同程度的抑制苗期生长的问题。复合肥以磷酸二铵作种肥为好，出苗安全，苗期生长健壮。