建立质量追踪体系，是GAP管理的核心，是产品质量管理监控手段。产品质量可追踪性，是指单个农户生产者或生产经营者组织的产品，可以从农户一直追踪到加工完成的成品，同时也可以从加工完成的成品反追回到它的源头——生产者。产品质量追踪实质上是对产品身份的识别，是保证产品质量的重要措施。
建立产品质量追踪的根本目的，在于明确产品的身份，确定产品质量问题的来源，一旦发现有质量问题的产品，可以追踪到特定的地区，乡村或农户，以便采取有效措施加以纠正，保证该地区产品的继续使用，为农户、消费者和社会提供潜在的益处，对稳定产品销售市场，保证和稳定产品质量都具有重要的意义。通过建立质量追踪体系，可以最大限度地保证产品生产质量的可靠性、稳定性、可以促进形成一种不断提高产品质量的新机制。