玉米由于是单性花、异花授粉，因此在杂交时，不需要去雄，因而也不需要整穗。其杂交方法和步骤主要为调节开花期、选株、隔离、采粉、授粉和收获等。
调节开花期
玉米由于单性花，在调节开花期方面，必须使母本的雌穗和父本的雄穗的花期一致。可用分期播种的方法调节父、母本的花期。
选株
父、母本均应选择生长健壮、无病虫害和具有本品种典型性状的植株，作为杂交对象。
套袋隔离
当母本植株的雌穗已经露出而没有伸出柱头以前，用牛皮纸袋套好雌穗。当母本雌穗开始抽出柱头时，要在当天用牛皮纸袋套在父本植株的雄穗上，雌、雄穗的纸袋，要用细绳或回形针扎紧，以免脱落。
采粉
从上述玉米的开花习性中可以知道，其雄穗在始花后的第2～4天内开花最多，进入盛花期，一天中开花最多的时间是上午8～10时，而此时花粉的生活力也最强；雌穗在始花后的第2～4天，处于盛花期，柱头已基本抽齐。因此，采粉时间应选择父、母本的盛花期、并选择上午8～10时进行采粉。采集花粉时，将父本雄穗稍稍下弯，轻轻抖动，用人工辅助授粉器盛接花粉、采粉时要防止其它品种的花粉混入。
人工辅助授粉器是用光滑的厚纸制成1个圆锥形的纸筒，用厚纸作纸盖盖住下口，另外用细铁丝网做成1个筛子，平放于低筒内。采集的花粉可通过筛子均匀授到柱头上。
授粉
授粉时，先取下雌穗上的纸袋，立即用人工辅助授粉器的下口对准雌穗的柱头，轻轻抖动授粉器，使花粉落在柱头上。
授粉后，仍用原来的纸袋将雌穗套好，但应在袋顶和穗顶之间留出一定的距离，以防止因果穗伸长而顶破纸袋。纸袋套好后，应在雌穗基部拴上纸牌（或塑料牌），写明杂交组合、授粉日期和操作者姓名等项内容。
收获
母本果穗成熟后，应连同纸牌（或塑料牌）一起单独收获，并单独保存，供来年播种检验杂交是否成功。