虽然所有的植物细胞都具有全能性，能够重新形成植株，但各种细胞在表现全能性、重新形成植株的能力并不相同。这种差别不仅表现在同一植株的不同部位、不同器官和不同组织上，而且还表现在植物种类、植株年龄、生长季节和生理状态上。因此，在决定选用一个合适的材料时，必须考虑以下一些因素：
①用哪一部分器官最适于作组织培养的材料；
②器官的生理状态和发育年龄；
③取材的季节；
④离体材料（外植体）的大小；
⑤取得离体材料的植株质量。
例如，许多兰科植物、石刁柏（Asparagus officinalis L.）和非洲菊（Gerbera jamesonii Bolus ex Gard.）用茎尖作材料最合适，而旋花科植物用根比较合适，秋海棠和茄科的一些植物适合于用叶等等。一般说来，处于生长季节的较幼嫩的材料，容易培养，接种时较大的外植体则有较大的再生能力。对于仅仅诱导愈伤组织的外植体，材料大小并无严格限制，只要将茎的切段、叶、根、花、果实或种子等的组织切成片状或块状，接种在培养基上即可。切块的具体大小一般在0.5厘米左右，太小时产生愈伤组织的能力弱，太大时，又会在培养瓶中占地方太多。至于茎尖、胚、胚乳的培养，则按器官或组织单位切离即可。