能抑制无义突变的抑制基因。由于发生无义突变的结果，蛋白质合成只能进行到发生这种突变的部位就中止下来。另外一个基因突变（抑制基因突变）结果使细胞内产生某种分子，可使蛋白质合成重新继续下去，因此抑制基因的突变的表型和野生型几乎一样或非常近似。在大肠杆菌中已知无义抑制基因突变的起因有tRNA基因的突变、核糖体蛋白质基因的突变两种情况。前者是对密码子有特异性的突变，后者在密码子方面是无特异性的。一般无义抑制基因依无义密码子的种类可以分成琥珀型抑制基因、赭石型抑制基因、乳白型抑制基因这三种类型。其中琥珀型抑制基因和乳白型抑制基因分别对琥珀型突变（UAG）和乳白型突变（UGA）是特异性的，但赭石型抑制基因不仅对赭石型突变（UAA）有作用，而且对琥珀型突变也有作用。tRNA结构基因由于抑制基因的突变而产生的变异tRNA，叫做抑制基因tRNA，一般代表无义抑制基因。当与某种氨基酸相对应的tRNA基因有数个时，抑制基因tRNA多数是由于其中一个tRNA基因发生突变，通常是在tRNA的反密码子部位中发生一个碱基置换，因而它能与无义密码子相对应。偶尔也有因反密码子以外的部位发生变化而成为抑制基因tRNA的。所以抑制基因tRNA决定着哪一种氨基酸可以插入到与无义密码子相对应的部位上去。已知大肠杆菌中存在着如表所示的九种无义抑制基因。