真核生物的基因组相当于基因的一股由只有一个复制DNA序列(也称单一DNA,unique sequence,single copy seqence,nonrepetitive sequence等)和具有多数反复存在的DNA顺序组成。称后者为重复顺序。组成基因组的DNA顺序,根据其重复的频度可分为三类。一是基因组只有一个复制顺序的单一DNA,二为高度重复顺序(highly repetitivesequence),由较短的顺序105—107次直线连结而成,其中含随体DNA等。第三为中等程度的重复顺序(moderately repetitive sequence),为有300—500个核苷对的大致相同的顺序——例如在将哺乳类的DNA用限制酶AluI(AG↓CT)切断时所产主的主要片断中所见到的高频率(105)的顺序(AluIfamily)——与单一DNA一起分散存在的,以及像核糖体RNA基因或组蛋白基因群那样的多次成直线相连存在的(多基因群)都包含在这一类中。此外有在反方向上重复的顺序(inverted repetitive seq-uence),其变性DNA折叠成发夹结构(hairpinstructure,foldback structure,snapback stru-cture),在编码分析中可迅速再结合的类型。