子囊孢子 (ascospore) 指产生在子囊菌子囊内的孢子。在即将形成孢子之前,子囊内进行核融合和减数分裂,一般一个子囊内产生8个孢子,普通为椭圆形,有的是针状态体或带有隔壁。在表面上可以看到纹、刺、网眼等。不同的特征,其颜色也各种各样:有的无色,有的淡黄色、淡红色、橙色、褐色及黑色等。普通在子囊内并列成一排,其一半与另一半性别各 。(例如脉孢菌属、麻孢壳属、Pleurage)。孢子一般在子囊内排成一列,其中半数与其他半数各为不同的性属(例如Neurospora,Gelasinospora,Pleurage)。