远缘杂交(distant hybridization)一般是指在分类学上物种(species)以上分类单位的个体之间交配。远缘杂种同近缘杂种相比，除了具有综合父、母双亲的遗传特性，能产生重组类型以及后代出现性状分离等作为杂种的基本特征外，还有一些特有的征状，如下：
①高度不育性。主要是由于染色体的不亲和与生理平衡受到严重干扰等引起的。
②杂种后代会出现“疯狂分离”现象。所谓“疯狂”是指后代性状分离的类型很多，稳定性差，有时甚至到十多代后还出现分离。
③杂种后代比较容易回复到亲本类型，这是因为远缘杂种的中间类型的生活力和育性都比较差，在选择压力下很容易被淘汰。
④有些远缘杂种在胚胎发育过程中，会发生一个亲本排斥另一亲本染色体的现象。
⑤远缘杂种的生活力一般低下，在很多情况下在胚胎期就死亡。
⑥远缘杂种不育是很普遍的现象。例如母马和公驴杂交生下的骡子不能生驹。但在植物中可用秋水仙素等化学药物处理杂种的生长点或分蘖节等有分生组织的部位，使体细胞的染色体加倍，变成异源四倍体，每一条染色体都有双份，就能像二倍体一样进行正常的减数分裂，形成可育的配子，这样，远缘杂种就可以有正常的繁殖能力。
