仅就目前的发展情况，微点阵芯片主要包括DNA微点阵芯片（又称基因芯片?或DNA芯片）和蛋白或多肽微点阵芯片两种。不过相信，基于其它生物大分子特异性相互作用的生物芯片也会相继问世。所谓DNA微点阵芯片是指同时将大量的探针分子固定到固相支持物上，借助核酸分子杂交配对的特异性对DNA样品的序列信息进行高效率的解读和分析，以用于基因表达谱的检测、突变筛查、DNA多肽性分析、DNA测序和基因组文库作图等研究。类似地，多肽或蛋白微点阵芯片则将许多序列不同的多肽或蛋白分子按照预定的位置固定于芯片片基上，通过蛋白或多肽与其特异结合分子的相互作用而实现对样品蛋白或其它配体作用特异性的研究，包括抗原表位分析、蛋白定量检查等。
已有多种方法可以将寡核苷酸、多肽或蛋白等生物大分子固定到固相支持物上。这些方法总体上分为两种：原位合成(in situ synthesis)与合成后以微量点样技术点样。生物芯片可用许多先进的固定技术进行制备同时也可实现自动化生产。每种方法都适于以玻片为支持物的芯片制作但有各自的优缺点。原位合成的具体方案有光引导原位合成(light- directed in situ synthesis)、压电打印原位合成以及分子印章技术等。
