生物碱大多数来自植物界,少数也来自动物界,如贤上腺素等。生物体内生物碱含量一般较低。至今分离出来的生物碱已有数千种。
生物碱的分类方法有多种。较常用和比较合理的分类方法是根据生物碱的化学构造进行分类,如麻黄碱属有机胺类,一叶萩碱、苦参碱属吡啶衍生物类,莨菪碱属莨菪烷衍生物类,喜树碱属喹啉衍生物类,常山碱属喹唑酮衍生物类,茶碱属嘌呤衍生物类,小檗碱属异喹啉衍生物类,利血平、长春新碱属吲哚衍生物类等。
生物碱多根据它所来源的植物命名,例如,麻黄碱是由麻黄中提取得到而得名,烟碱是由烟草中提取得到而得名。生物碱的名称又可采用国际通用名称的译音,例如烟碱又叫尼古丁(nicotine)。