生物机体在种系进化和个体发育过程中逐步获得的防卫能力。主要包括三个方面：机体抵抗外界传染性因子的免疫防护功能；机体清除损伤和死亡细胞，维持自身生理平衡的自身稳定功能；对机体监视，发现并清除突变细胞的免疫监视功能。在正常生理条件下，机体的免疫系统依靠其先天具有的免疫能力及后天获得的免疫能力发挥共同免疫作用，保持机体的生理功能相对稳定。若免疫功能发生异常，必然会导致机体生理功能的失调，从而出现病理性变化。机体的免疫功能概括如下表。
免疫防护功能主要针对外来抗原物质。在正常情况下，可防止或摧毁病原微生物及其毒素或其他抗原异物的侵入及危害，保证机体不患病。若此功能过低，则说明免疫系统有缺陷，易出现反复感染等一类免疫缺陷综合症。若此功能过高，则会导致不同类型的变态反应的发生。自身稳定功能在正常情况下，可及时清除损伤及坏死的细胞，维持机体免疫系统的平衡。此功能过低或过高时，都会导致对外源性抗原或内源性抗原发生免疫调节失常。特别是过高时，常可引起各种自身免疫病的发生。免疫监视功能可有效地防止突变细胞引起的肿瘤病的发生。