机体防御抗原异物进入其体内的一种特殊的生理解剖学结构。被称为机体的“第一道防线”，是发挥非特异性免疫功能的重要组成部分。主要包括皮肤粘膜屏障、血脑屏障和血胎屏障等。
皮肤粘膜屏障 健康完整的皮肤及粘膜包裹着机体，它们可以机械性地阻挡病原微生物及其他抗原异物侵入机体；鼻孔中的鼻毛、呼吸道粘膜表面的粘液和纤毛，均能阻挡并排除抗原异物的侵入。皮肤及粘膜能经常分泌杀菌物质。皮肤的汗腺分泌的乳酸、皮脂腺分泌的脂肪酸都呈酸性，不利于病原细菌的生长；唾液、泪液、乳汁以及呼吸道分泌液中的溶菌酶能溶解革兰氏阳性细菌。胃液中的胃酸也有很强的杀菌能力。此外，在皮肤、粘膜及机体与外界相通的腔道中生长的正常菌群，与人体保持互相依赖、互相制约的平衡状态，正常菌群通过其生长代谢所分泌的代谢产物，对病原菌的侵入起有效的杀伤作用。
血脑屏障 是存在于血脑循环中的一种生理解剖学结构。它是由软脑膜、脉络丛的脑毛细血管壁和包在壁外的神经胶质细胞形成的胶质膜构成。近年来，据电镜和酶标技术研究证明，血脑屏障的组织学部位主要是脑毛细血管内皮细胞层。这层细胞具有连结紧密、胞饮作用微弱的特点，可有效地阻挡病原微生物及其他抗原异物通过血流进入脑组织或脑脊液，从而保护了机体的中枢神经系统。婴幼儿由于血脑屏障尚未发育完善，较易发生脑膜炎等中枢神经系统的感染。
血胎屏障 是由母体的子宫内膜的基蜕膜和胎儿绒毛膜共同组成。此屏障不影响母子间的物质交换，但在一般情况下可防止母体内的病原菌进入胎儿体内。使胎儿免受感染。血胎屏障与妊娠期有关。在妊娠头3个月内，该屏障尚未发育完善。此时若母体患风疹等病毒性感染，则病原体可通过胎盘进入胎儿体内，常可造成胎儿畸形、流产或死亡。