内分泌系统是指一群特殊化的细胞组成的内分泌腺（endocrine gland）。它们包括垂体、甲状腺、甲状旁腺、肾上腺、性腺、胰岛、胸腺及松果体等。这些腺体分泌高效能的有机化学物质（激素），经过血液循环而传递化学信息到其靶细胞、靶组织或靶器官，发挥兴奋或抑制作用。激素也称内分泌为第一信使。随着内分泌学研究的进展，对内分泌系统产生了新的认识。除了上述内分泌腺外，在身体其它部分如胃肠道粘膜、脑、肾、心、肺等处都分布有散在的内分泌组织，或存在兼有内分泌功能的细胞，这些散在的内分泌组织也属于或包括在内分泌系统内。除此之外，对内分泌或激素的概念也有新的认识。经典的激素是指从内分泌细胞所分泌的激素要经过血液循环运输到远距离的靶细胞（远距分泌），现在认为有一些内分泌细胞所分泌的化学物质可通过细胞间隙弥散作用于邻近细胞，这类化学物质称为局部激素，分泌方式称近距离分泌。
内分泌系统与中枢神经系统在生理功能上，紧密联系，密切配合，相互作用，调节机体的各种功能，维持内环境的相对稳定，以适应机体内外环境的各种变化及需要。此外，内分泌系统间接地或直接地接受中枢神经系统的调节，也可以把内分泌系统看成是中枢神经调节系统的一个环节。内分腺系统也影响中枢神经系统的活动。