物流仓储作为保税区的主要功能之一，对保税区的发展起到重要作用，但目前全国各家保税区却不同程度地存在一些仓储货物数年压库的“死库现象”。
以张家港保税区为例，由于委托方音信全无、企业倒闭、涉嫌骗汇等原因，目前散布于各仓储企业内的超出两年以上仓储期限的货物达10多种，涉及机电设备、办公用品、纺织制剂、食品等，有的货物甚至仓储期限已近10年之久。仓储积压货物占用了大量仓库面积，不少货物均已明显锈蚀、腐败、变质，既影响到其他正常货物的仓储，又极易产生环境污染问题。企业既无法收回仓储费，又无法处理，对此反响极大。
由于《保税区海关监管办法》对仓储货物的储存期限未作出规定，海关无法依法定职权主动介入，对这些货物采取有效措施，只能建议和敦促仓储企业向法院起诉主张民事权利、申请认定无主财产等，使仓储企业尽快合法取得货物的处置权，解决历史遗留难题。在此，张家港保税区海关提醒广大区内仓储企业，在与货主签订仓储保管合同时，应按照仓储保管合同的范式操作，必须写明仓储期限，并且一定要明确超期违约对货物的处置条款，以规避风险，维护自身合法权益。