1、功能性食品配料
作为功能食品的提出，日本远比西方要早。所有食品均含某些维持健康和生理机能的营养成分，但功能食品应该具有独特的生理活性和功效。在1984年，日本文部省就在“食品机能系统的解析的拓展”中强调食品的第三功能，使用功能食品这一名称，并推动国内广泛的研究；在民间，由企业组成了功能食品联络机构。就在1990年，有一种用低聚糖和维生素C配制的功能饮料“OligoCC”，当年销售达9000万瓶。1991年厚生省实施营养改善法，建立自愿申报审批的特定保健用品管理办法，把一部分功能食品纳入这一范畴，但规定必须是加工食品形式，如乳制品、谷物食品饮料、调味品、糖果等，不包括像药丸、胶囊、复合剂或其他类似于有特殊防病作用的食品，也不在其内，但功能性低聚糖配制的调整肠道帮助消化外，尚有控制血压、中和脂肪，补充矿物质，控制血糖，降低胆固醇，防龋齿等。据日本保健和营养协会(JHNFA)报道，1999年特定保健用食品销售总额1.824亿美元，其中用低聚糖作帮助消化的特定保健食品销售额8912万美元，占总销售额的4％。所使用的低聚糖品种有低聚果糖、大豆低聚糖、低聚木糖、乳果糖、乳酮糖、低聚半乳糖、低聚异麦芽糖等。所制食品有饮料、药、饼干、布丁、发酵乳、调味醋、巧克力等。截至1999年10月，特殊保健食品已批准171种，新近批准用功能性低聚糖配制具有双歧杆菌增殖调节肠道功能的品种有Nippon制粉用棉籽糖的汤类，Lotte用低聚木糖的糖果，EzakiGlico用乳果糖的饼干和糖果。
在欧洲，功能性低聚糖不作为食品添加剂管理，作为食品配料广泛应用于各类食品，像Orafti低聚果糖成功应用于酸乳、饮料、乳酪、馅料、冰淇淋、焙烤、巧克力、糖果、肉制品等。如比利时的FYOS和西班牙市场的Sveltesse是含低聚果糖的乳饮料；荷兰市场的MusliNotenreep是含低聚果糖的米粉点心prculoDomo等公司生产的低聚半乳糖，由于其热稳定性好，能应用于乳制品，饮料、糖果、点心、冷冻甜点、面包、果酱、蜂制品、肉制品等，例如有低聚半乳糖2－4g/瓶和3－4g/100ml的清凉饮料、2－3g/100g的特制婴儿饼干，1－4g/100g的脆米饼等。
在我国，虽然功能性低聚糖的工业化生产始自1996年，但经五年发展，已具有一定规模，年产3万吨左右。目前大部分作为食品配料使用，从绝对消费量来看，已和目标接近。在食品工业中的应用，我国较多地应用于含乳饮料，少量用于糖果、酒类，有一部分作为保健品或保健品的配料上市，有很多食品还没有涉及。总的来说，应用的品种较少，即使用得较多的饮料，在饮料行业中也是小品种。保健食品也是花色繁多，绝对用量较小的部门。和日本、欧洲比较，还有很多食品行业的应用尚待开发，要根据中国的国情，中国人的饮食习惯，向着能进入一日三餐的方便营养食品和满足社会不同人群特殊食品需要的方向去努力开拓。
2、低聚糖饲料：我国饲料工业已发展成为我国工业体系中重要的支柱产业之一，已跃居世界第二大生产大国。按照1996－2020年我国饲料工业发展中、长期发展规划，到2010年我国配合饲料的产量达到1亿吨，浓缩饲料1200万吨，预混合饲料300万吨，对饲料添加剂的需求将大幅增加，低聚糖饲料添加剂将大有作为。
低聚糖对动物也有和人体相似的功效。自1960年以来有很多报道，但在饲料中大规模使用是近十多年的事，只是在低聚糖有了工业规模生产以及能被饲料工业接受的适当价格以后才有可能。
低聚糖添加于饲料的主要功效为：(1)促进双歧杆菌增殖； (2)提高排便速度； (3)减少血氨浓度； 4)增进矿物质吸收； 5)增强免疫能力。
关于饲用实验效果，现将国内外不同品中低聚糖的饲用结果列于表
此外还有不少关于低聚糖对预防沙门氏菌感染以及减少幼禽畜下痢的报道。最近，国内不少单位和低聚糖生产企业配合进行的试验结果也确认，低聚糖作为饲料的功能性添加剂，其结果是肯定的。
3、低聚糖农药：21世纪人类面临的挑战中，粮食对人类生存与发展具有重要意见。我国现在耕地占世界的7％，到2005年人口将达到13.5左右，将占世界总人口的25％。保持农业可持续发展，农药在我国具有重要地位。
4、低聚糖新型生物农药具有以下优点：水溶性好；对人畜无害；不污染环境；长期或多次诱导不会使植物产生特异抗病性；使用剂量低而且价格与有机农药相近。低聚糖农药在水果、蔬菜病害防治中的安全性也是低聚糖农药的特色。随着目前人们对绿色食品的需求量日趋增加，低聚糖农药的市场将越来越大，寡聚糖生物农药作为一类新型的植物激素及植物抗性激活因子在农作物生长发育和病虫害防治中具有广阔的开发前景。
5、低聚糖生化肥料：低聚糖对土壤微生物也有菌群调节作用，能提高化肥的利用率。当前，对环境的污染贡献率已达到40％。使用生化肥料是农业领域中的向往，低聚糖素大有作为。
科学技术的进步与生物技术的发展，对人类的生活产生了重要的影响，不仅仅是社会经济的空前繁荣，同时也有环境、健康等领域的空前压力。低聚糖的异军突起，已介入了医药、食品、饲料及农业领域，对缓解社会压力、提高人们生活水平具有重要作用。