备案号是指进出口企业在海关办理加工贸易合同备案或征、减、免税审批备案等手续时，海关给予《进料加工登记手册》、《来料加工及中小型补偿贸易登记手册》、《外商投资企业履行产品出口合同进口料件及加工出口成品登记手册》（以下均简称《登记手册》）、《进出口货物征免税证明》（以下简称《征免税证明》）或其他有关备案审批文件的编号。
具体填报要求如下：
1.加工贸易报关单本栏目填报《登记手册》编号；少量低价值辅料按规定不使用《登记手册》的，填报“C+关区代码+0000000”，不得为空；
2. 凡涉及减免税备案审批的报关单，本栏目填报《征免税证明》编号，不得为空；
3.无备案审批文件的报关单，本栏目免于填报。
备案号长度为12位，其中第1位是标记代码。备案号的标记代码必须与“贸易方式”及“征免性质”栏目相协调，例如：贸易方式为来料加工，征免性质也应当是来料加工，备案号的标记代码应为“B”。