棉花生产中，应根据作物需肥特点、需肥规律进行合理施肥。过去的非抗虫棉花品种对氮、磷、钾的需求比例是3∶1∶3，而现在普遍种植的转基因抗虫棉对钾反应敏感，需钾量大，其对氮、磷、钾的需求比例以3∶1∶4.5为宜。根据施肥“最小养分律”和“不可替代律”的基本原理，若钾肥、微肥缺乏，就是施用再多的氮肥、磷肥也达不到理想效果。因此，稳施氮肥、磷肥，增施钾肥，补施微肥，让棉花“吃饱”和“吃好”，才能最大限度地实现高产高效。
1、合理施底肥 按照“养分归还学说”的原理，根据棉花的需肥特点，结合当前实际，一般亩产350～400公斤的棉田，每亩底施尿素10公斤、磷酸二铵20公斤、优质钾肥（纯钾含量50%以上）30公斤。中产田一般每亩底施磷酸二铵、钾肥各20公斤即可。为利于棉花的持续增产，应尽量多施农家肥。若每亩补施微肥（含锌、硼、锰、钼、铜、铁6种微量元素）800～1600克，增产效果更为显著。
2、科学追肥 磷、钾肥最好一次性底施。氮肥宜分期追施，一般肥力棉田可在盛蕾期追施30%的氮肥、花铃期追施70%的氮肥，超高产棉田可在蕾期追施20%的氮肥、花铃期追施60%的氮肥、桃期追施20%的氮肥。同样的施肥量，氮肥分期追施比一次性追施增产10%以上。
3、巧施叶面肥 叶面施肥是较经济有效的施肥方式，成本低、效果好。应选用以氮、磷、钾为主（特别是在苗期和生育后期）的叶面肥，也可以搭配施用含植物生长剂、含微量元素的叶面肥。在棉花生长期间，可用0.5%～2%磷酸二铵或0.2%磷酸二氢钾或0.15%～0.3%抗病增产王溶液，结合防治病虫害叶面喷施，效果较好。