一、避免用于敏感作物和作物的敏感期。不同作物和品种对氯的敏感性和忍耐性有很大差异。对氯敏感的作物称为忌氯作物，有烟草、茶叶、柑橘、葡萄、西瓜、马铃薯、紫云英等，一般不施或严格控制含氯化肥施用量。同一类作物不同品种抗氯性有差异，如水稻品种之间，以杂交稻耐氯性最强。常规早稻耐氯性较弱，且要避开作物的氯敏感期。作物的氯敏感期多在苗期，如水稻在3叶-5叶期；小麦在2叶期-5叶期；大白菜、小白菜和油菜在4叶-6叶期。
二、讲究施用方法。用含氯化肥做基肥时应提早深施并盖土，一般在播种或移苗前一个星期施用，施在种子或幼苗下侧，以距表土5厘米-7厘米处为宜。作追肥时：采取穴施或条施，并与作物植株相距5厘米-10厘米，切忌撒施。施用量大时，可分2次-3次追施。追肥亦可兑水或兑稀粪尿水浇施。
三、尽量在降雨量较多的季节和地区施用。在多雨的季节或降水较多的地区施用含氯化肥，氯离子可随水淋失，不易在土壤中积累，因而可避免对作物产生副作用。而无灌溉条件的旱地、排水不良的盐碱地和高温干旱季节以及缺水少雨地区最好不用或少用含氯化肥。
四、配合施用腐熟的有机肥和磷肥。在施用含氯化肥时，配合施用腐熟的有机肥，可以提高肥效，减轻氯离子对土壤的不良影响；在有效磷含量低的土壤中，氯离子对作物吸收磷有抑制作用。因此，施含氯化肥时应配施适量的磷肥。用含氯化肥与尿素、磷酸铵、过磷酸钙、钙镁磷肥等配制而成的复（混）合肥、配方肥，不仅可以减轻氯离子的危害，而且由于氮、磷、钾得到配合使用，可起到平衡施肥的效果。