饲用酶制剂一般分为单一酶制剂和复合酶制剂两种。
1.单一酶制剂的生产方法
单一酶制剂是纯酶制剂加载体或稀释剂混合而成，纯酶制剂的工业化生产一般都是用微生物液体发酵法生产的，该法是利用液态培养基在容积为50～100 m3发酵罐，进行通风搅拌培养，待微生物充分生长繁殖并合成大量的微生物酶后，将酶分离、提取纯化，制成一定形式的酶制剂。酶的分离提取需经过细胞破碎、抽提、离心、过滤、浓缩、干燥等全部过程。该法的优点：①液态培养基的流动性大，对工艺条件（如温度、溶氧、pH、营养成分等）的控制较容易，有利于自动化生产；②由于在密闭的发酵罐内纯菌发酵，因而所产的酶纯度质量也较稳定；③具有机械化程度高、劳动强度小、设备利用率高等优点。其缺点：①产酶量较少；②酶的组分不完全；③耗能量多；④分离提取难度较大；⑤设备多而复杂、投资多、不易上马等。
2.饲用复合酶的生产方法
众所周知，由于影响畜禽配合饲料消化因素是多方面的，单一酶作为添加剂的作用必然很有限，为了更好地提高饲料营养价值和畜禽消化能力，充分利用酶的协同作用，发挥其综合效应，同时使用多种酶复合使用显得十分重要，所以近十年来，世界各国普遍研制饲用的多酶系统，生产饲用复合酶产品。
生产符合配方要求的复合酶的方法有如下两种：
1）完全复配法
生产或购买各种单一酶制剂，按配方复配，再加分散剂、稀释剂而成。这种方法只要求酶制剂质量可靠，配方执行非常精确。它的缺点很多，商品纯酶制剂成本已经很高，如再用多种纯酶制剂进行复配，配制出的饲用复合酶的成本就会更高，限制了其应用，再者这种方法生产的饲用复合酶很难获得除酶功能以外可促进动物生长的一些未知生长因子等。
2）固体发酵法
固体发酵法也称麸曲培养法，该法是利用麸皮或米糠为主要原料，另视需要添加其他成分，加水拌成含水量适度的固态物料作为培养基，供做微生物繁殖和产酶用。固体发酵法也是古老的工艺，其缺点：易受杂菌污染，因此所产酶纯度较差；固态原料的利用率较低，又因固体发酵的条件控制不易均匀，所产酶的质量就难稳定；生产劳动强度大、占用场地多等。它也有许多优点：①单位体积培养设备中的产酶量高；②节省动力；③由污染引起的问题少；④酶抽提液浓度可任意调节；⑤后处理设备少；⑥投资少，技术易掌握，易上马。对固体发酵的研究正在重新引起重视。随着生物技术、发酵工业的发展和进步，固体发酵的缺点会逐步被克服。国内传统的酿造制品如白酒、酱油生产的酒曲、酱油曲、酿酒工业的糖化曲等都在采用固体发酵法。此法适于使用霉菌生产酶制剂。固体发酵法又有以下两种具体方法：
①单菌种固体发酵，补加酶法 采用单一菌株发酵，再复配一定种类、一定量的纯酶制剂，其酶成分有所改善，但成本增高。
②多菌株混合固体发酵，自然互补酶系法 大多数微生物菌株只有一个酶活突出，因而可采用几个菌种混合发酵、互补产酶，让每个菌株最大产酶性能发挥出来，生产出的酶不但组成全面、活性高、功能强，而且成本也较低，应用效果好，但该技术难度非常大。
