一个分流阀允许你在质谱仪开始前将流动相的部分转换成废物。对于包含所有未保留成分的部分来说，这一点尤为重要——其中许多成分可能涉及并污染电离源。如果你真的想让东西保持清洁使用一个分流阀把所有的东西都分流掉除了感兴趣的化合物。

一些制造商有方法声称允许你在LC-MS仪器使用磷酸盐和其他不挥发的缓冲液。虽然理论上这是可能的，但尽量避免使用磷酸盐，坚持使用我们都熟悉和喜爱的经过测试的挥发性缓冲液。积累的不挥发物质不仅会堵塞采样孔，还会改变电离源的每个静电元件产生最佳离子所需的电压。

虽然许多现代仪器都允许你使用较高的高效液相色谱流速，但使用传统的最佳流速0.2-0.3 mL/min仍然是一个好主意。更高的流量意味着更多的流动相，因此，更多的污染进入电离源。要么使用柱后分离器，要么使用较窄的内经(理想情况下为2.1 mm)柱，这允许较高的移动相线速度(cm/sec)，但限制了体积流量(mL/min)。 

我们都这样做过——在柱上装载高浓度的物质，以提高较小组分的灵敏度。这在快速污染电离源方面也做得很好。如果可能的话，使用分流阀将所有集中的材料分流到废物中。如果你必须让浓缩的分析物进入电离源(例如检查纯度峰值)，试着限制你的进样量。

质谱分析仪在运行时是最可靠的。排气装置增加了磨损，并有损坏许多部件的危险。一个昂贵的组件涡轮泵特别容易在排气是损坏，它被设计在高真空操作。当第一次打开真空时，会有一股大气气流，对涡轮叶片，尤其是轴承造成很大的压力。这大大加速了涡轮的磨损。

这些泵在正常使用时消耗少量的油(如“雾”)，需要定期补充。此外，许多通过MS的溶剂和材料最终溶解在旋转泵油中，使其降解，增加了旋转泵部件的磨损。需要在推荐的间隔内抽油和更换。对于更频繁的油维护-一些旋转(前向线)泵允许用户“镇流器”泵去除更多的挥发性污染物。这通常是简单地通过使用泵上的阀门来实现的，应该每周进行一次，以保持在MS内的真空质量——从而保持仪器的灵敏度!

虽然大多数现代系统会提醒你任何类型的空气泄漏，即使一个小的泄漏会增加真空和探测器组件的磨损。如果你认为有漏洞，尽快修复它。

清洗电离源的拆卸越多，损坏某些脆弱部件的可能性越大，而且错误组装的可能性也越大。在错误地安装了一个组件之后，我们可能不得不因为相同的错误而两次拆卸电离源。确保你遵守制造商的指导方针——其中许多现在可以在网上以视频的形式找到。

为了使流动相蒸发，电离源必须加热，温度必须与流速匹配(这取决于仪器，所以请参阅操作手册)。过低的温度会阻止喷雾蒸发，并导致流动相组分的浪费。相反，它们会被喷洒到电离源元件上，增加污染。