菠菜属于耐寒性绿叶菜类，其耐寒性很强。在我国北方地区冬季多采用冻藏和冷藏等方式进行贮藏，以调剂和满足市场的需求。
    菠菜的栽培品种有圆叶型和尖叶型两种类型。应选择叶厚、色深的尖叶型类型或尖、圆叶型的杂交种进行贮藏。这类品种耐寒性强，适合于贮藏。菠菜的适宜贮藏温度为0℃，也可在-4～-2℃下冻藏。适宜相对湿度为95%～100％。
    用于贮藏的菠菜在栽培中应避免过量施用氮肥，采收前 1周尽量不要灌溉，以免菠菜软弱徒长，不耐贮藏。采收时间要选在早晚，避开正午。采收后立即进行预冷。菠菜是预冷效益最大的蔬菜之一，即预冷容易(时间短、耗电少)、效果大(比不进行预冷的菠菜新鲜，且贮藏期也大为延长)。真空预冷时20分钟左右即可将温度降至5℃左右。
1．冻藏
    在风障或房屋等的遮阴处(北侧)，挖几条平行的贮藏沟，沟宽35厘米，沟深20～30厘米。沟与沟之间隔20厘米左右。将菠菜以散状或小捆状直立码在沟内。沟内放满菜后，薄薄盖一层沙土。随气温下降增加覆土的厚度，使沟内温度不低于-8℃。
    当沟宽为1米以上时，沟底要挖2～3条通风道。通风道的深、宽各约15厘米，两端通向地面作为通风口。通风沟上面(贮藏沟底部)铺一层秫秸，秫秸上码菠莱。
    冻贮之后的菠菜要在0℃左右的条件下，花3～4天来解冻。如果解冻温度过高，菠菜会变得软烂，不能恢复新鲜状态。    2．塑料薄膜包装
    预冷后的菠菜装入厚0.08～0.1毫米，长110厘米，宽80厘米的聚乙烯袋中，平放在架子上，敞口一昼夜，次日松扎袋口。库温需维持在±0.5℃。贮藏初期1个月检查一次质量，以后每隔15天检查一次。据报道，采用此法春菠菜可贮藏30天左右，秋菠菜可贮藏80天左右。