微波对食品具有热效应和非热效应的双重作用。微波热效应机理是：生物细胞是由水、蛋白质、核酸、碳水化合物、脂肪和有机物等复杂化合物构成的一种凝聚态介质。该介质在强微波场的作用下，温度升高。温度升高的结果是，食品内部的水分温度同时升高而蒸发得到烘干或烘烤，细菌在热力的作用下得到消灭。另一方面，在微波的作用下，食品分子的空间结构发生了变化或破坏，细菌的蛋白质溶解度、粘度、膨胀性、稳定性都受到破坏，从而失去生物活性。
　　
　   微波干果干燥技术原理：
　　
　　一、微波焙烤的同时，伴随杀菌效应。微波杀菌是在微波的热效应和非热效应的双重作用下进行的，相比常规的温度杀菌能在较低的温度和很短的时间内获得满意的杀菌作用。一般的杀菌温度在80℃左右，处理时间在3~5分钟，且能最大限度的保持其营养成分。
　　
　　二、使用操作方便。微波功率和传送带速度均可无级调节，不存在热惯性，可即开即停，简单易控。改善生产环境。微波设备无余热辐射、无粉尘、无噪音、无污染，易于实现食品卫生的检测标准。
　　
　　三、低温杀菌、营养成分损失少。微波杀菌是在微波的热效应和非热效应的双重作用下进行的，相比常规的温度杀菌能在较低的温度和很短的时间内获得满意的杀菌作用。一般的杀菌温度在80℃左右，处理时间在3~5分钟，且能最大限度的保持其营养成分。并且不影响原有风味，是果蔬食品深加工，获得绿色食品的良好手段。