菌种复活。秸秆发酵活干菌每袋3克，可调制干秸秆1吨，或青秸秆2吨。在处理秸秆前，先将菌剂倒入200毫升水中充分溶解，然后在常温下放置1～2小时，使菌复活。

菌液的配置。将复活好的菌剂倒入充分溶解的0.8%～1.0%食盐水中拌匀。

秸秆铡(揉、粉)碎。麦秸、稻草比较柔软，可用铡草机铡碎成2～3厘米的长度。玉米较粗硬，可用揉碎机加工成丝条状，以提高利用率及适口性。

秸秆入窖。在窖底铺放20～30厘米厚的粉碎秸秆，均匀喷洒菌液水，使秸秆含水率达60%～70%。喷洒后及时踩实，再铺放20～30厘米厚秸秆，喷洒菌液、踩实等。如此一层层装填原料，直到高出窖口40厘米时再封口。

封窖。在秸秆分层压实到高出窖口30～40厘米，在最上层均匀撒上食盐粉，盖塑料薄膜。食盐用量每米3250克，其目的是确保微贮饲料上部不发生霉烂变质。盖塑料薄膜后，在上面铺20～30厘米厚的稻草或麦秸，覆土15～20厘米，密封。