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微生物的敏感性
不同的病原微生物，对消毒药的敏感性有很明显的不同。例如病毒对碱和甲醛很敏感，而对酚类的抵抗力却很大。大多数的消毒药对细菌有作用，但对细菌的芽胞和病毒作用很小。因此，在消毒时应根据病原的特点选用消毒药。
环境中有机物质的影响
当环境中存在大量的有机物如畜禽的粪、尿、血、炎性渗出物等时，能阻碍消毒药直接与病原微生物接触，而影响消毒药效力的发挥。另一方面，由于这些有机物往往能中和、吸附部分药物，也使消毒作用减弱。因此，在消毒药物使用前，应进行充分的机械性清扫，清除消毒物品表面的有机物，使消毒药能充分发挥作用。
消毒药的浓度
一般说来，消毒药的浓度愈高，杀菌力也就越强，但随着药物浓度的增高，对活组织的毒性也就相应地增大了。另一方面，当浓度达到—定程度后，消毒药的效力就不再增高。因此，在使用中应选择有效和安全的杀菌浓度。例如70％的酒精杀菌效果要比95％的酒精好。
消毒药的温度
消毒药的杀菌力与温度成正比，温度增高，杀菌力增强，因而夏季消毒作用比冬季要强。
药物作用的时间
一般情况下，消毒药的效力与作用时间成正比，与病原微生物接触的时间越长，其消毒效果就越好。作用时间若太短，往往达不到消毒的目的。
