茄子采收后，在阴凉的室内预贮10天左右才入窖，否则易出现烂果。入窖前用浓度30～40微升/升的2，4-D或50～80微升/升防落素等喷洒果柄，以防果柄脱落。贮藏时，在窖底铺6～7厘米厚的干沙土，以调节窖内湿度。在靠窖墙周围，用苇秆等材料围好。在窖两侧由里向外堆码茄子，在窖中间和两端留出空地，以便人员进出和管理。圆茄贮藏时，第一层茄子果柄向下埋入沙中，第二层茄子果柄向上，第三层茄子果柄应与第二层茄子的萼片相接触，以免刺伤果面。每层两侧边缘的茄柄向外，逐层码放3层。若茄子较小，可码放4层。长茄贮藏时，按头对头、尾对尾方式码放。茄子码放好后，上面盖一层牛皮纸或报纸，再盖塑料薄膜或蒲席，以保持湿度，并防止通风时直接吹及果面。

茄子贮藏的适宜温度为10～12℃，空气相对湿度为95%。贮藏初期，外界气温较高时，应根据窖内的温度、湿度适当通风。外界气温较低时须做好防寒工作。