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防治芹菜叶斑病，应以预防为主，治疗为辅。其具体措施有：
一、选择无病种子：加强种子繁育田管理，选择地上部分不带病菌的母根移栽，不连作或重茬、迎茬。在无病的种株上采种。
二、加强苗床管理：育苗前要搞好床土消毒，加强育苗期管理，适量浇水。育苗期间要遮阳、防雨、防露。
三、严格消毒处理：用 50-60℃温水浸种，或2%的氢氧化钠浸种，或用0.1%的甲基托布津浸种，浸种后捞出晾种12-18小时，然后播种。
四、移栽后管理：施用充分腐熟的农家肥，浇水次数、数量要因天气、长势、土壤等因素情况灵活掌握。及时摘除病死体带出棚外焚烧或深埋。化肥施入应分期进行，严禁一次施用过多引起徒长。
五、药剂防治：芹菜发生叶斑病后，要积极进行用药防治。其具体做法是：发病初期用70%的代森锰锌可湿性粉剂500倍液，或75%的百菌清可湿性粉剂600倍液，或70%的甲基托布津可湿性粉剂800倍液喷雾，每隔7-10天喷1次，连喷2-3次。
