存在于双翅目昆虫幼虫的唾腺细胞、肠细胞、气管细胞和马尔比基小管细胞中的巨大染色体。上述类型细胞永远处于间期阶段，染色体脱氧核糖核酸（DNA）连续多次复制，而无核及胞质之分裂，故产生多股细长的染色单体，并列构成较体细胞染色体大百倍以上的巨大染色体。DNA含量为体细胞的千倍。多线染色体上有许多横行带纹，由DNA纤维上经一定间隔、有规律的袢环区整齐而致密地排列在一起所形成。带纹处DNA含量高、着色深；带纹间透明区为带间，DNA含量低，染色浅。每条带纹代表特异基因区。在个体发育特定阶段，多线染色体上有的带纹疏松而膨大，形成胀泡（puff），更大的胀泡被称为巴尔比尼氏环（Balbianiring），是基因转录的形态指标。用3H-尿嘧啶掺入多线染色体，胀泡区被标记，表明该区活跃合成核糖核酸（RNA）。不同部位的带形成胀泡与昆虫幼虫发育阶段不同有关，处于动态变化中。多线染色体是研究基因表达调控的有效手段和理想材料。除上述细胞外，多线染色体也见之于某些原生生物和有花植物中。